Analiza mutacji zaburzających tworzenie nalotu woskowego u żyta oraz ocena ich wpływu na cechy morfologiczne, biochemiczne i fizjologiczne
Numer Projektu: UMO-2015/17/B/NZ9/01694 (Konsorcjum naukowe „WaxyGen” )
Finansowanie: NCN
Kierownik projektu:
Beata Myśków (Kierownik projektu)
Ilona Czyczyło-Mysza (Kierownik zespołu IFR PAN)
Wykonawcy:
Beata Myśków
Ilona Czyczyło-Mysza (IFR PAN)
Magdalena Góralska
Katarzyna Malinowska
Paweł Milczarski
Stefan Stojałowski
Michał Dziurka (IFR PAN)
Arkadiusz Telesiński
POPULARNONAUKOWE STRESZCZENIE PROJEKTU
Żyto jest zbożem, uprawianym głównie w Europie, na powierzchni blisko 5 mln hektarów. Cenione jest ze względu na swoje walory odżywcze i dietetyczne, zwłaszcza przez zwolenników zdrowej żywności. Żyto jest źródłem błonnika, zawiera więcej w porównaniu z pszenicą witamin i mikroelementów. Spośród wszystkich gatunków zbożowych żyto najlepiej znosi niekorzystne warunki klimatyczne, między innymi zimowe mrozy do -25°C, bez okrywy śnieżnej. Charakteryzuje się ponadto wyjątkową odpornością na suszę i silną odpornością na choroby. Niektóre ze swych korzystnych cech żyto może zawdzięczać woskowej powłoce okrywającej nadziemne części roślin i nadającej roślinom charakterystyczny niebieskawy kolor.
Przedmiotem badań są nietypowe rośliny – mutanty pozbawione wosku na powierzchni liści i łodyg. Podstawowym materiałem badawczym są cztery pary linii wsobnych żyta. Każda para reprezentuje dwie grupy roślin, prawie identyczne pod względem genetycznym, ale różniące się obecnością nalotu woskowego (linie bliskoizogeniczne). Można się spodziewać, że wszystkie różnice wykryte w obrębie danej pary linii będą miały związek z obecnością/brakiem woskowej powłoki.
Linie bliskoizogeniczne posłużą do poszukiwania genów odpowiedzialnych za tworzenie prawidłowego nalotu woskowego. Do realizacji tego celu wykorzystane zostaną nowoczesne metody molekularne, w tym technologie wysokoprzepustowe, takie jak NGS (sekwencjonowanie metodami nowej generacji). Te technologie pozwalają na jednoczesne badanie sekwencji DNA lub RNA na masową skalę, dając równocześnie setki tysięcy odczytów. Poza informacją o zróżnicowaniu w ekspresji badanych genów, wyniki jakie uzyskamy przy użyciu NGS wzbogacą ogólną wiedzę o genomie żyta.
Aby dokładnie scharakteryzować różnice między roślinami pokrytymi woskiem i pozbawionymi takiej ochrony planowane jest wykonanie pomiarów wybranych parametrów morfologicznych, biochemicznych i fizjologicznych. Badania biochemiczne będą obejmowały analizę składu chemicznego wosków, za pomocą metod chromatograficznych. Analizy fizjologiczne będą miały na celu poszukiwanie różnic w reakcji roślin z woskiem i bez wosku w różnych warunkach środowiska. Ponieważ rośliny pozbawione woskowej warstwy ochronnej mogą być bardziej narażone na stres, celem badań jest określenie w jakim stopniu różne rodzaje defektów w tworzeniu nalotu wpływają na odpowiedź roślin na suszę. Wskaźnikiem reakcji roślin na warunki stresowe jest między innymi efektywność wykorzystania wody w procesie fotosyntezy. Planowane jest więc badanie fotosyntezy a także wymiany gazowej, bilansu wodnego i zawartości barwników asymilacyjnych. Charakterystyka fizjologiczna będzie wykonywana z zastosowaniem następujących urządzeń: gazoanalizatora, porometru, spektrofotometru i fluorymetru.