Dr inż. Anna Nowicka
Publikacje
-
- Nowicka A.
- Kovacik M.
- Maksylewicz A.
- Kopeć P.
- Dubas E.
- Krzewska M.
- Springer A.
- Hoffie R.E.
- Daghma D.S.
- Milec Z.
- Pecinka A.
- Kumlehn J.
- Żur I.
- The transcriptional landscape of the developmental switch from regular pollen maturation towards microspore-derived plant regeneration in barley.
- 2024.
- The Crop Journal.
-
- Kovacik M.
- Nowicka A.
- Zwyrtková J.
- Strejčková B.
- Vardanega I.
- Esteban E.
- Pasha A.
- Kaduchová K.
- Krautsova M.
- Červenková M.
- Šafář J.
- Provart N.J.
- Simon R.
- Pecinka
- The transcriptome landscape of developing barley seeds.
- 2024.
- The Plant Cell, 36: 2512–2530.
Projekty
-
MRiRW nr 4,
Identyfikacja czynników warunkujących indukcję embriogenezy mikrospor u pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.) -
2015/18/M/NZ3/00348,
Rola stresu oksydacyjnego w regulacji embriogenezy w kulturach izolowanych mikrospor pszenżyta (x Triticosecale Wittm.) i jęczmienia (Hordeum vulgare L.)
WYKSZTAŁCENIE I STOPNIE NAUKOWE
2013 doktor nauk rolniczych (wyróżnienie); specjalność: genetyka i hodowla roślin, KGHiN URK
2009-2010 Studium Pedagogiczne dla Absolwentów Szkół Wyższych, Centrum Pedagogiki i Psychologii, Politechnika Krakowska im. Tadeusza Kościuszki
2007-2011 Studia Doktoranckie w Katedrze Genetyki, Hodowli i Nasiennictwa Uniwersytetu Rolniczego im. Hugona Kołłątaja w Krakowie (KGHiN URK)
2007 magister inż. biotechnologii stosowanej; specjalność: biotechnologia roślin, MSB ARK
2002-2007 Studia Wyższe w Międzywydziałowym Studium Biotechnologii Akademii Rolniczej (obecnie Uniwersytet Rolniczy) im. Hugona Kołłątaja w Krakowie (MSB ARK)
PRZEBIEG PRACY ZAWODOWEJ
2015-2016 DAAD post-doc w Max Planck Institute for Plant Breeding Research (Kolonia, Niemcy)
od 2014 adiunkt w Instytucie Fizjologii Roślin Polskiej Akademii Nauk w Krakowie (IFR PAN)
TEMATYKA BADAWCZA
Identyfikacja czynników epigenetycznych determinujących podłoże procesu androgenezy u roślin użytkowych.
Organizacja roślinnego genomu jądrowego na poziomie chromosomowym.
Mechanizmy naprawy DNA u roślin.
PRAKTYCZNE UMIEJĘTNOŚCI
Cytogenetyka/cytogenetyka molekularna:
Preparatyka chromosomów mitotycznych i mejotycznych. Izolowanie jąder komórkowych.
Znakowanie sond molekularnych.
Fluorescencyjna hybrydyzacja in situ (FISH).
Genomowa hybrydyzacja in situ (GISH).
Immunolokalizacja zmetylowanego DNA (5mC) oraz zmodyfikowanych form białek histonowych.
Akwizycja i składanie obrazów mikroskopowych.
Pomiary chromosomów, konstrukcja kariogramów i idiogramów.
Cytometria przepływowa (FACs).
Biologia molekularna/bioinformatyka:
Izolacja plazmidowego i genomowego DNA, izolacja RNA, ligacja, transformacja z wykorzystaniem E.coli, amplifikacja DNA (PCR), RT-PCR, RT-qPCR, genotypowanie, techniki elektroforetyczne.
Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) w tym RNA-seq, obsługa programów do analizy sekwencji oraz biologicznych bazy danych.
Kultury in vitro:
Zakładanie i prowadzenie kultur in vitro.
Transformacja materiału roślinnego przy wykorzystaniu Agrobacterium tumefaciens i Agrobacterium rhizogenes.
PUBLIKACJE do 2014
Macko-Podgorni A., Nowicka A., Grzebelus E., Simon P.W., Grzebelus D. 2013. DcSto: carrot Stowaway-like elements are abundant, diverse, and polymorphic. Genetica, 141:255-267. doi 10.1007/s10709-013-9725-6.
Nowicka A., Grzebelus E., Grzebelus D. 2012. Fluorescent in situ hybridization with arbitrarily amplified DNA fragments differentiates carrot (Daucus carota L.) chromosomes. Genome, 55: 1-9. Strona wydawcy.
Czernicka M., Nowicka A., Klein M., Muras P., Grzebelus E. 2011. A cytogenetic approach for the evaluation of hybryd state in Rhododendrons. American Rhododendron Society, 6(1): 10-13.
Czernicka M., Nowicka A., Klein M., Muras P., Grzebelus E. 2010. Paternity determination of interspecific rhododendron hybrids by genomic in situ hybridization (GISH). Genome, 53: 277-284. Strona wydawcy.
Publikacje według cytowań wraz z indeksami dostępne na portalach: